Table 1 Comparison of distribution of variants in TALLYHO/Jng to that in FVB/NJ

5 kb upstream or downstream

7.731 %

9.895 %

7.496 %

8.167 %

5′ or 3′ UTR

0.434 %

0.433 %

0.291 %

0.298 %

Intronic

19.360 %

19.880 %

18.896 %

19.057 %

Synonymous coding

0.307 %

0.204 %

Non-synonymous coding

0.176 %

0.103 %

Essential splice site

0.000 %

0.000 %

0.000 %

0.001 %

Stop gain

0.002 %

0.000 %

0.000 %

0.000 %

Stop lost

0.000 %

0.000 %

0.000 %

0.000 %

In-frame codon insertion or deletion

0.016 %

0.011 %

Frameshift

0.014 %

0.005 %

Two or more consequences

15.436 %

15.710 %

20.401 %

21.467 %

Within, or 5Kb upstream or downstream from, non-coding gene or mature microRNA

6.240 %

6.280 %

2.362 %

2.403 %

Intergenic

50.314 %

47.772 %

50.246 %

48.591 %