From: Genetics and mapping of a new anthracnose resistance locus in Andean common bean Paloma
SNP id | NCBI ss# id | Physical position (bp)a | BARCBEAN6K_3 SNP ID | Primers sequencesb, c, d |
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SS75 | ss715645931 | 48838736 | BARCPV_1.0_Chr01_48838736_G_A | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGTGTTATGTGTAGATATATTGAAAGGC F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTACTGTGTTATGTGTAGATATATTGAAAGGT R: TGATCTCTTAATGGGAGGTTTGTTGCTT |
SS76 | ss715645913 | 49001931 | BARCPV_1.0_Chr01_49001931_C_T | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCAGCTTCTACCCGTGGCTGC F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGCAGCTTCTACCCGTGGCTGT R: GTCGCTTCTAGTTGTCTTTAATTATCTTAT |
SS77 | ss715645900 | 49181319 | BARCPV_1.0_Chr01_49181319_T_C | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCAGTTGAACATTATGTTACAGACTACTTT F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCAGTTGAACATTATGTTACAGACTACTTC R: AAACCTAAACTAATAACAAAATTTATGTAT |
SS78 | ss715645883 | 49329790 | BARCPV_1.0_Chr01_49329790_T_C | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTATTAGGCTGTTCAAGCTTTCCAGGT F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAGGCTGTTCAAGCTTTCCAGGC R: CACCCCAATTACATTTTCTCTTTATGAATT |
SS79 | ss715645868 | 49487812 | BARCPV_1.0_Chr01_49487812_C_T | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGCCGCTGGTGAAGATGAATACC F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCGCCGCTGGTGAAGATGAATACT R: CGTGTATGCGACCCGGTCGAA |
SS80 | ss715645856 | 49617274 | BARCPV_1.0_Chr01_49617274_G_A | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTATATTTGTTATTATGGTGTCATCATATCTTAA F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTATATTTGTTATTATGGTGTCATCATATCTTAAT R: GTTTGAACTGATGTAATAACTGAACCTATA |
SS81 | ss715645862 | 49742126 | BARCPV_1.0_Chr01_49742126_G_A | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTATTGAAGATAAGTACTATCGATGATATCAG F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGTATTGAAGATAAGTACTATCGATGATATCAA R: GTGAGGTAGTTCGATCCTCTTGAGAT |
SS82 | ss715645258 | 50155987 | BARCPV_1.0_Chr01_50155987_T_C | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAAAACCAGGTTTATTGTCCTAGTTTACAA F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAACCAGGTTTATTGTCCTAGTTTACAG R: GTATCTCATCTTGTTGCAAGAGTGAATATA |
SS83 | ss715645248 | 50546985 | BARCPV_1.0_Chr01_50546985_T_C | F1: GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCATATACTTTCTGGGTGTAAACTCTGA F2: GAAGGTCGGAGTCAACGGATTATATACTTTCTGGGTGTAAACTCTGG R: CCCAGGTGTTCTGGTCATGAGTTAT |