Protein | Gene | All stages | Stage I | Stage II | Stage III | Stage IV | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
p* | FDR | beta | p* | FDR | beta | p* | FDR | beta | p* | FDR | beta | p* | FDR | beta | ||
HSP70 | HSPA1A | 0.20 | 0.27 | 0.11 | 4.3 × 10 −4 | 0.05 | 0.59 | 0.72 | 0.97 | 0.11 | 0.62 | 0.79 | −0.08 | 0.89 | 0.95 | −0.02 |
Rad51 | RAD51 | 3.0 × 10−7 | 4.0 × 10−6 | 1.25 | 8.9 × 10 −4 | 0.05 | 1.93 | 0.35 | 0.93 | 1.0 | 0.06 | 0.41 | 0.70 | 0.03 | 0.16 | 1.07 |
YAP_pS127 | YAP1 | 3.8 × 10−5 | 2.8 × 10−4 | 0.67 | 0.24 | 0.61 | 0.48 | 7.5 × 10 −4 | 0.08 | 2.18 | 0.07 | 0.41 | 0.42 | 0.21 | 0.42 | 0.40 |
STAT5-alpha | STAT5A | 0.18 | 0.26 | −0.20 | 0.90 | 0.96 | 0.04 | 8.9 × 10 −4 | 0.08 | −2.76 | 0.08 | 0.41 | −0.40 | 0.19 | 0.39 | −0.31 |
GAB2 | GAB2 | 2.3 × 10−10 | 4.1 × 10−8 | −0.67 | 6.9 × 10−3 | 0.12 | −0.55 | 0.49 | 0.93 | −0.31 | 4.5 × 10 −5 | 5.9 × 10−3 | −0.78 | 0.06 | 0.22 | −0.40 |
MIG-6 | ERRFI1 | 4.2 × 10−10 | 4.1 × 10−8 | −1.12 | 0.04 | 0.23 | −0.67 | 0.59 | 0.93 | −0.43 | 6.3 × 10 −5 | 5.9 × 10−3 | −1.46 | 0.09 | 0.29 | −0.55 |
MAPK_ pT202_Y204* | MAPK1, MAPK3 | 2.3 × 10−8 | 5.8 × 10−7 | −0.53 | 0.57 | 0.80 | −0.11 | 0.60 | 0.93 | −0.20 | 3.0 × 10 −4 | 0.019 | −0.65 | 0.05 | 0.20 | −0.33 |
PEA-15 | PEA15 | 2.6 × 10−8 | 5.8 × 10−7 | 1.41 | 0.45 | 0.74 | −0.41 | 0.03 | 0.52 | 1.87 | 5.0 × 10 −4 | 0.023 | 1.59 | 2.2 × 10−3 | 0.037 | 1.38 |
TIGAR | C12ORF5 | 1.2 × 10−3 | 4.5 × 10−3 | 0.90 | 0.07 | 0.33 | 1.43 | 0.63 | 0.93 | 0.89 | 0.89 | 0.94 | −0.06 | 1.3 × 10 −5 | 1.9 × 10−3 | 2.74 |
FASN | FASN | 2.0 × 10−6 | 2.1 × 10−5 | 0.91 | 0.87 | 0.96 | 0.07 | 0.30 | 0.93 | 0.80 | 0.34 | 0.58 | 0.34 | 2.3 × 10 −5 | 1.9 × 10−3 | 1.29 |
AR | AR | 9.5 × 10−10 | 5.9 × 10−8 | −1.22 | 1.3 × 10−3 | 0.05 | −1.34 | 0.92 | 0.99 | −0.07 | 0.01 | 0.21 | −0.92 | 3 × 10 −5 | 1.9 × 10−3 | −1.19 |
S6 | RPS6 | 3.7 × 10−4 | 1.7 × 10−3 | 0.70 | 0.75 | 0.89 | 0.12 | 0.86 | 0.97 | 0.14 | 0.66 | 0.81 | −0.15 | 8.8 × 10 −5 | 4.1 × 10−3 | 1.38 |
ACC1 | ACACA | 9.1 × 10−9 | 2.8 × 10−7 | 0.88 | 5.1 × 10−3 | 0.10 | 1 | 0.86 | 0.97 | −0.13 | 0.19 | 0.46 | 0.35 | 3.6 × 10 −4 | 0.01 | 0.86 |
Cyclin_B1 | CCNB1 | 5.9 × 10−7 | 7.3 × 10−6 | 0.60 | 0.40 | 0.71 | 0.32 | 0.37 | 0.93 | 0.37 | 0.70 | 0.82 | 0.10 | 7.1 × 10 −4 | 0.02 | 0.63 |
GATA3 | GATA3 | 0.02 | 0.04 | 0.54 | 0.51 | 0.79 | 0.32 | 0.49 | 0.93 | 0.59 | 0.17 | 0.45 | 0.52 | 7.4 × 10 −4 | 0.02 | 1.07 |