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Table 6 Core sets of the 129 quinoa accessions identified using POWERMARKER

From: Development of novel InDel markers and genetic diversity in Chenopodium quinoa through whole-genome re-sequencing

Core set size

 

4

7

10

13

16

Accessions (group)

PI 478411 (G1S1)

 

Y

   

PI 510538 (G1S1)

 

Y

Y

Y

Y

PI 510539 (G1S1)

Y

Y

Y

Y

Y

PI 510541 (G1S1)

    

Y

PI 510542 (G1S1)

    

Y

PI 510544 (G1S1)

   

Y

Y

PI 510548 (G1S1)

   

Y

Y

PI 614881 (G1S2)

Y

 

Y

  

PI 614902 (G1S2)

    

Y

PI 614904 (G1S2)

   

Y

 

PI 614905 (G1S2)

   

Y

 

PI 614906 (G1S2)

 

Y

   

PI 614909 (G1S2)

   

Y

Y

PI 614911 (G1S2)

  

Y

 

Y

PI 614912 (G1S2)

    

Y

PI 614913 (G1S2)

    

Y

PI 614914 (G1S2)

 

Y

   

PI 614928 (G1S2)

 

Y

Y

Y

Y

PI 614929 (G1S2)

  

Y

Y

Y

PI 614932 (G1S2)

  

Y

  

PI 614933 (G1S2)

    

Y

Ames 13,725 (G2)

Y

Y

Y

Y

 

Ames 13,740 (G2)

   

Y

 

Ames 13,747 (G2)

  

Y

Y

Y

Ames 13,754 (G2)

    

Y

NSL 92331 (G2)

Y

    

PI 584524 (G2)

  

Y

  

PI 634918 (G2)

   

Y

 

Allele number

 

320

350

356

361

362

  1. Y represents that accessions selected in corresponding core set
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BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

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