BMC Genomics

Table 3 Simulation results for Scenario II

From: Clustering multilayer omics data using MuNCut

Parameters				M _accuracy
n	q	h	ρ	MuNCut	KM	SC	HC	KM*	SC*	HC*	LC	FGC
200	400	0.15	0.20	0.026	0.365	0.462	0.582	0.13	0.122	0.188	0.139	0.155
200	400	0.15	0.40	0.025	0.411	0.476	0.564	0.133	0.119	0.202	0.158	0.157
200	400	0.25	0.20	0.095	0.409	0.475	0.566	0.131	0.122	0.19	0.163	0.163
200	400	0.25	0.40	0.118	0.409	0.473	0.563	0.124	0.12	0.202	0.157	0.155
400	400	0.15	0.20	0.024	0.412	0.469	0.564	0.13	0.125	0.204	0.155	0.152
400	400	0.15	0.40	0.024	0.413	0.475	0.567	0.129	0.123	0.197	0.155	0.153
400	400	0.25	0.20	0.096	0.413	0.469	0.564	0.128	0.113	0.20	0.162	0.159
400	400	0.25	0.40	0.111	0.411	0.479	0.565	0.125	0.134	0.203	0.153	0.151
200	800	0.15	0.20	0.113	0.399	0.436	0.561	0.129	0.118	0.179	0.152	0.174
200	800	0.15	0.40	0.132	0.397	0.443	0.560	0.138	0.138	0.194	0.144	0.143
200	800	0.25	0.20	0.132	0.405	0.432	0.562	0.127	0.12	0.18	0.181	0.151
200	800	0.25	0.40	0.142	0.397	0.442	0.56	0.138	0.137	0.197	0.208	0.164
400	800	0.15	0.20	0.106	0.402	0.443	0.560	0.129	0.129	0.184	0.148	0.149
400	800	0.15	0.40	0.134	0.394	0.452	0.559	0.14	0.137	0.198	0.141	0.140
400	800	0.25	0.20	0.13	0.391	0.431	0.546	0.125	0.122	0.189	0.180	0.149
400	800	0.25	0.40	0.141	0.396	0.429	0.561	0.143	0.142	0.196	0.165	0.213
200	1200	0.15	0.20	0.127	0.383	0.412	0.554	0.137	0.131	0.161	0.145	0.176
200	1200	0.15	0.40	0.143	0.404	0.441	0.558	0.14	0.138	0.186	0.218	0.149
200	1200	0.25	0.20	0.137	0.393	0.417	0.558	0.142	0.14	0.178	0.224	0.219
200	1200	0.25	0.40	0.148	0.393	0.434	0.56	0.141	0.14	0.188	0.163	0.238
400	1200	0.15	0.20	0.126	0.398	0.426	0.559	0.14	0.142	0.183	0.194	0.147
400	1200	0.15	0.40	0.14	0.396	0.427	0.559	0.142	0.141	0.184	0.192	0.221
400	1200	0.25	0.20	0.126	0.401	0.428	0.560	0.139	0.141	0.181	0.165	0.220
400	1200	0.25	0.40	0.142	0.397	0.420	0.559	0.143	0.147	0.187	0.165	0.242

n is the sample size; q is the number omics measurements in each layer;
h measures the strength of regulation across layers; ρ is the correlation coefficient among CNVs

Back to article page

ISSN: 1471-2164

Contact us

Submission enquiries: bmcgenomics@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com