Population genomics and morphometric assignment of western honey bees (Apis mellifera L.) in the Republic of South Africa

Eimanifar, Amin; Brooks, Samantha A.; Bustamante, Tomas; Ellis, James D.

doi:10.1186/s12864-018-4998-x

Table 8 Pairwise F_ST values computed using 2449 SNPs from honey bees collected from 28 geographical regions in the Republic of South Africa. European A. mellifera (AM) was included as a single region in the dataset

From: Population genomics and morphometric assignment of western honey bees (Apis mellifera L.) in the Republic of South Africa

	BL	KR	PT	SP	UP	OD	PB	PE	RD	SF	ST	SW	TR	WD	MF	MB	LB	LA	KN	GT	GE	CT	CD	BD	GR	BW	EL	KL	AM
BL	0
KR	0.03	0.00
PT	0.04	0.04	0.00
SP	0.04	0.05	0.06	0.00
UP	0.03	0.04	0.05	0.03	0.00
OD	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.00
PB	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.00
PE	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.00
RD	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.04	0.04	0.00
SF	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.00
ST	0.05	0.05	0.06	0.07	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.00
SW	0.05	0.06	0.06	0.07	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.00
TR	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.00
WD	0.06	0.06	0.07	0.07	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.06	0.00
MF	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.00
MB	0.05	0.05	0.07	0.06	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.00
LB	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.06	0.03	0.04	0.03	0.00
LA	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.00
KN	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.06	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.00
GT	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.00
GE	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.00
CT	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00
CD	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00
BD	0.10	0.10	0.12	0.12	0.10	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.07	0.07	0.11	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.00
GR	0.03	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.08	0.00
BW	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.09	0.04	0.00
EL	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.07	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.09	0.03	0.04	0.00
KL	0.05	0.05	0.06	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.09	0.04	0.05	0.05	0.00
AM	0.23	0.22	0.26	0.27	0.23	0.27	0.25	0.23	0.22	0.29	0.23	0.25	0.30	0.24	0.24	0.28	0.26	0.24	0.22	0.24	0.22	0.24	0.22	0.35	0.22	0.25	0.28	0.26	0.00

The geographical abbreviations are shown in Table 1. The significant values of all pairwise comparisons are based on Bonferroni correction (P < 0.05)

Back to article page

ISSN: 1471-2164

Contact us

Submission enquiries: bmcgenomics@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com

BMC Genomics

Contact us