Host species | Family | Number of copies | Genomic proportion (%) | Base pair masked in genome | Average length | |||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | LTRH | RM > 4 kb | RM > 2 kb * | RM | ||||
Mercenaria mercenaria | SteMemer | 7 | 7 | 8 | 156 | 0.01 | 148,438 | 951 |
1858 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Mercenaria mercenaria YKG | SteMemer | 5 | 6 | 7 | 166 | 0.01 | 148,344 | 894 |
1788 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Ruditapes philippinarum | SteRuphi | 0 | 0 | 3 | 22 | 0.00 | 21,751 | 989 |
1123 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Cyclina sinensis | SteCysin | 2 | 2 | 1 | 64 | 0.01 | 54,243 | 848 |
903 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Dreissena rostriformis | SteDrros | 5 | 5 | 5 | 65 | 0.01 | 78,925 | 1214 |
1242 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Anadara broughtonii | SteAnbro1 | 5 | 5 | 0 | 176 | 0.01 | 104,324 | 593 |
885 Mb | SteAnbro2 | 5 | 5 | 5 | 153 | 0.01 | 114,234 | 747 |
 | SteAnbro3 | 5 | 7 | 15 | 216 | 0.02 | 177,833 | 823 |
Crassostrea gigas | SteCragi | 1 | 1 | 10 | 99 | 0.01 | 96,188 | 971 |
648 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Crassostrea virginica | SteCavi | 0 | 0 | 1 | 70 | 0.01 | 42,104 | 601 |
685 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Saccostrea glomerata | SteSaglo | 4 | 5 | 9 | 284 | 0.03 | 203,715 | 717 |
788 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Bathymodiolus platifrons | SteBapla | 3 | 3 | 8 | 216 | 0.01 | 168,122 | 778 |
1658 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Modiolus philippinarum | SteMophi | 2 | 2 | 13 | 244 | 0.01 | 195,023 | 799 |
2630 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Limnoperna fortunei | SteLifor | 1 | 5 | 19 | 142 | 0.01 | 161,653 | 1138 |
1673 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |
Mytilus coruscus | SteMycor1 | 2 | 4 | 3 | 96 | 0.00 | 93,720 | 830 |
1904 Mb | SteMycor2 | 9 | 11 | 6 | 265 | 0.01 | 256,509 | 968 |
Mytilus galloprovincialis | SteMygal1 | 1 | 1 | 10 | 81 | 0.01 | 92,780 | 1145 |
1282 Mb |  |  |  |  |  |  |  |  |