From: High diversity in the regulatory region of Shiga toxin encoding bacteriophages
Bioproject ID (NCBI) | Country | Source | No of samplesa | Stx type | Eru type | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
L | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | |||||
PRJNA285020 | Netherlands | Human | 134 | Stx1 | 5 | 3 | 30 | 1 | 2 | |||||||||
Stx2 | 4 | 10 | 13 | 1 | 2 | 2 | ||||||||||||
PRJEB6447 | Norway | Human | 97 | |||||||||||||||
Stx1 | 1 | 4 | 10 | 1 | 2 | 1 | ||||||||||||
Stx2 | 1 | 12 | 1 | 6 | 14 | 2 | 2 | 1 | ||||||||||
PRJNA680568 | Switzerland | Human | 19 | |||||||||||||||
Stx1 | ||||||||||||||||||
Stx2 | 12 | |||||||||||||||||
PRJNA694525 | Switzerland | Dog/cat fodder | 32 | |||||||||||||||
Stx1 | 2 | 8 | ||||||||||||||||
Stx2 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | |||||||||||||
PRJNA438214 | Switzerland | Human | 18 | |||||||||||||||
Stx1 | ||||||||||||||||||
Stx2 | 15 | |||||||||||||||||
PRJNA248042 | England | Human | > 3000 | |||||||||||||||
Stx1 | 37 | 3 | 3 | 1 | 1 | |||||||||||||
Stx2 | 23 | 5 | 2 | 26 | ||||||||||||||
PRJNA70699 | France | Human | 8 | |||||||||||||||
Stx1 | 1 | |||||||||||||||||
Stx2 | 1 | 2 | ||||||||||||||||
PRJNA715185 | Germany | Flour | 56 | |||||||||||||||
Stx1 | ||||||||||||||||||
Stx2 | 5 | |||||||||||||||||
PRJNA666781 | Italy | Raw milk cheese | 7 | |||||||||||||||
Stx1 | 4 | |||||||||||||||||
Stx2 | ||||||||||||||||||
PRJNA643688 | Portugal | Cattle | 12 | |||||||||||||||
Stx1 | 1 | 3 | 1 | |||||||||||||||
Stx2 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||||||
Total number sample of each Eru typeb | Stx1 | 40 | 14 | 3 | 0 | 21 | 31 | 6 | 5 | 2 | 5 | 0 | 1 | 1 | 1 | |||
Stx2 | 6 | 37 | 6 | 0 | 0 | 2 | 18 | 83 | 5 | 0 | 6 | 2 | 2 | 1 |