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Table 1 Peaks in the density-plots locating known or inferred ICRs in 3 mammalian species

From: Along the Bos taurus genome, uncover candidate imprinting control regions

Genomic loci

ICRs/gDMRs Mouse

ICRs human

DMRs Bos taurus

Gpr1-Zdbf2

Y

N

A

Gnas

Y

Y

Y

Mcts2

Y

N

N

Nnat

Y

Y

Y

Mest iso

Y

Y

Y

Nap1l5

Y

Y

Y

Sgce-Peg10

Y

N

Y

Rasgrf1

Y

N

N

H19-Igf2

Y

Y

Y

Kcnq1 locus

Y

Y

Y

Inpp5f_v2

Y

Y

Y

Peg3

Y

Y

Y

Snrpn

Y

N

Y

Plagl1 iso./Zac1

Y

Y

Y

Grb10

Y

Y

A

Zrsr1

N

N

C

IG-DMR

Y

N

A

Peg13

Y

N

C

Igf2r-Airn

Y

N

Y

Impact

N

N

A

  1. Y yes, N no, A ambiguous, iso isoform, C comment
  2. In the build BosTau8, the browser did not locate Peg13 and Zrsr1
  3. The build of analyzed genomes consisted of: mouse, mm9; human, hg19; Bos taurus, BosTau8
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BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

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