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Table 4 Zygosity screening for T2 plants of line #1416 for the OCP1 insertion on chromosome 15

From: High-throughput detection of T-DNA insertion sites for multiple transgenes in complex genomes

 

Chr15:982,591

Chr18:7,461,224

Chr8:24,442,089

T2 Plant

PCR A/B

Het

Hmz

WT

PCR A/B

Het

Hmz

WT

PCR A/B

Het

Hmz

WT

1

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

2

 + / - 

 

X

 

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

3

- / + 

  

X

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

4

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

5

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

6

- / + 

  

X

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

7

- / + 

  

X

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

8

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

9

 + / + 

X

  

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

10

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

11

 + / + 

X

  

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

12

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

13

- / + 

  

X

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

14

- / + 

  

X

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

15

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

16

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

17

 + / + 

X

  

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

18

 + / - 

 

X

 

 + / - 

 

X

 

 + / + 

X

  

19

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

 + / + 

X

  

Total trangene positive:

14

   

19

   

19

   
  

Het

Hmz

WT

 

Het

Hmz

WT

 

Het

Hmz

WT

Segregation ratio:

 

8

6

5

 

12

7

0

 

19

0

0

  

57.14%

42.86%

35.71%

 

63.16%

36.84%

0.00%

 

100.00%

0.00%

0.00%

  1. Results of PCRs A and B are presented for each of the T2 individuals on the left. Columns on the right indicate the zygosity categorization for each T2 individual (denoted as “X”) evaluated on the basis of the combined result in column A/B. Segregation ratios reflect the total number of each category.