Table 4 List of SNP markers identified by genome-wide association using combined and separate data (2018 & 2019). SNPs in bold are those significantly associated at least in two data sets

COD

S3_101063428

3

50,039

4.46E-04

S1_100689072

1

202,417

6.46E-05

S1_100693199

1

28,956

8.28E-04

S1_100997735

1

54,446

8.13E-05

S2_18893366

2

2096

8.54E-05

S2_100944099

2

275,709

3.72E-05

S4_18895871

4

22,187

4.58E-05

S2_100756057

2

284,159

5.64E-05

S1_100842346

1

109,989

5.71E-05

S1_100802428

1

228,448

8.09E-05

S10_18892924

10

1320

8.42E-05

COL

S1_100927695

1

171,377

0.0005

S1_100374249

1

14,226

1.32E-04

S1_100693199

1

28,956

7.28E-04

S1_100374249

1

14,226

0.000769

S2_100809767

2

97,399

2.78E-04

S1_100934305

1

53

0.000839

S1_100927695

1

171,377

3.39E-04

S7_18912893

7

134

3.47E04

S6_101039431

6

17,094

4.23E-4

S12_100811923

12

15,826

6.91E-04

CRD

S2_100843507

2

1849

8.89E-05

S3_100998987

3

7027

0.000473

S1_100693199

1

28,956

6.28E-04

S3_100998987

3

7027

0.000337

S1_100574592

1

6750

0.000836

S1_100574591

1

6750

0.000367

S1_100582688

1

39,446

0.000864

S3_101010746

3

381

0.000399

S1_100582688

1

39,446

0.000417

CRL

S1_18896887

1

116,872

0.000591

S1_100892740

1

27,909

0.000442

S1_100681096

1

10,631

0.000667

NA

NA

NA

NA

S6_100839526

6

171,520

0.000626

S1_100892740

1

27,909

0.000792

S7_100839525

7

703

0.000626

CRW

S1_18891752

1

199,716

0.000589

S1_18891752

1

199,716

3.31E-08

S4_100974332

4

10,835

0.000464

S2_18891794

2

93,043

1.65E-05

S1_100678415

1

246,142

0.00089

DM

S1_100579053

1

13,403

0.000121

S1_100677594

1

117,831

0.000249

S2_100587991

2

50,903

0.000175

S1_18896636

1

361,107

0.000184

S1_18905350

1

150,792

0.000896

S3_100795476

3

325,970

0.000899

S3_100795476

3

325,970

0.000188

S1_100378035

1

58,608

0.000396

S1_100678255

1

918,125

0.000805

NCR

S3_101024887

3

232

0.000812

S1_18896897

1

123,749

0.000836

S1_100680602

1

4856

3.07E-05

S1_18878040

1

658,024

3.12E-05

S1_100755696

1

49,669

0.000119

S1_18908588

1

64,068

0.000152

S5_100689668

5

333,890

0.000262

S1_100375214

1

97,399

0.000286

S10_100964255

10

606

0.000318

S1_100990433

1

481,249

0.000458

S1_100918481

1

53,052

0.000478

S1_18892187

1

18,934

0.000502

S1_100897692

1

781,657

0.000667

NLPP

S1_100584471

1

57,350

4.53E-05

S1_100584471

1

57,350

7.48E-05

S1_100693199

1

28,956

0.001452

S9_100959651

9

9359

0.000294

S2_100685734

2

32,330

0.000512

PH

S1_100839334

1

189,378

0.000108

S1_101059919

1

34,704

0.000363

S1_100836468

1

297,222

0.000134

S1_18895647

1

66,399

0.00025

S1_100379454

1

379,757

0.000728

S2_100946429

2

325,580

0.00018

S1_100579053

1

13,403

0.000386

S3_101024887

3

232

0.000465

S1_100798136

1

34,573

0.000729

S2_100839596

2

17,956

0.000706

S2_100801959

2

1457

0.000751

PL

S1_100765786

1

34,841

0.00024

S2_100688934

2

113,866

1.15E-07

S1_100747947

1

230,442

5.17E-05

S2_100874072

2

215,874

0.000242

S1_100381240

1

479,002

0.000264

S2_100892757

2

29,173

6.05E-05

S1_100898140

1

43,180

0.000375

S1_100681342

1

3737

0.000284

S1_100836468

1

297,222

0.000104

S10_101005079

10

377,504

0.000508

S1_100917554

1

419,632

0.000552

S2_100946429

2

325,580

0.000108

S3_100944639

3

1101

0.000767

S1_100683489

1

91,412

0.000195

S3_100982330

3

267,759

0.000862

S2_101010732

2

776

0.00061

YPH

S1_100379475

1

36,727

0.000636

S2_100944099

2

275,709

0.000411

S1_100592663

1

348,550

0.000211

S1_100896936

1

81,628

0.000139

S1_100381260

1

156,721

0.000461

S3_100379409

3

984

0.000343

S1_100934187

1

17,817

0.000552

S1_18896636

1

361,107

0.000669

S2_100587991

2

50,903

0.000553

S2_100587991

2

50,903

1.56E-05

S1_100896936

1

81,628

0.000833

S1_18895526

1

147,250

0.000603

S2_100688888

2

209,908

0.000495

S1_100584829

1

7043

0.000837

S5_100869929

5

102,007

0.000604

S2_18913028

2

1,313,949

0.000723

S5_101068528

5

274

0.000853

YPP

S1_100753561

1

59,137

0.000331

S1_100974034

1

2747

0.000356

S2_100587991

2

50,903

8.67E-08

S1_100586420

1

102,751

0.000484

S2_100754258

2

757

0.000236

S1_100802848

1

184,891

0.000883

S2_100690401

2

8539

0.000643

S4_18904835

4

294,901

0.000941