Analysis of codon usage patterns in 48 Aconitum species

Yang, Meihua; Liu, Jiahao; Yang, Wanqing; Li, Zhen; Hai, Yonglin; Duan, Baozhong; Zhang, Haizhu; Yang, Xiaoli; Xia, Conglong

doi:10.1186/s12864-023-09650-5

BMC Genomics

Table 1 Frequency distribution of ENC ratios

From: Analysis of codon usage patterns in 48 Aconitum species

Species	-0.15~-0.05	-0.05 ~ 0.05	0.05 ~ 0.15	0.15 ~ 0.25	0.25 ~ 0.35
A. angustius	0.038	0.396	0.485	0.151	0
A. austrokoreense	0.037	0.444	0.407	0.926	0.019
A. barbatum	0.057	0.340	0.453	0.151	0
A. barbatum var. hispidum	0.037	0.389	0.426	0.148	0
A. barbatum var.puberulum	0.075	0.377	0.396	0.151	0
A. brachypodum	0.075	0.340	0.453	0.132	0
A. bulleyanum	0.075	0.377	0.377	0.151	0
A. carmichaelii	0.057	0.396	0.485	0.132	0
A. chiisanense	0.057	0.485	0.396	0.132	0
A. ciliare	0.076	0.377	0.396	0.151	0
A. coeranum	0.057	0.321	0.434	0.170	0.019
A. contortum	0.057	0.396	0.485	0.113	0.019
A. delavayi	0.057	0.396	0.396	0.132	0.019
A. duolouxii	0.057	0.340	0.453	0.151	0
A. episcoplale	0.057	0.358	0.434	0.132	0.019
A. finetianum	0.075	0.340	0.434	0.151	0
A. flavum	0.057	0.358	0.453	0.132	0
A. forrestii	0.057	0.377	0.485	0.151	0
A. hemsleyanum	0.094	0.321	0.485	0.132	0.038
A. jaluense subsp. jaluense	0.057	0.377	0.434	0.132	0
A. japonicum subsp. napiforme	0.038	0.485	0.485	0.132	0
A. kusnezoffii	0.057	0.378	0.434	0.132	0
A. longecsaaidatum	0.038	0.385	0.404	0.154	0.019
A. monanthum	0.038	0.378	0.453	0.132	0
A. nagarum	0.075	0.321	0.453	0.151	0
A. ouvrardianum	0.075	0.302	0.472	0.151	0
A. pendulum	0.075	0.321	0.472	0.132	0
A. piepunense	0.075	0.340	0.434	0.151	0
A. pseudolaeve	0.019	0.396	0.434	0.151	0
A. puchonroenicum	0.038	0.377	0.485	0.170	0
A. quelpaertense	0.057	0.340	0.434	0.170	0
A. ramulosum	0.075	0.321	0.453	0.151	0
A. reclinatum	0.077	0.327	0.462	0.135	0
A. scaposum	0.057	0.358	0.434	0.151	0
A. scaposum var.vaginatum	0.058	0.327	0.423	0.192	0
A. sinomontanum	0.094	0.245	0.528	0.132	0
A. stapfianum	0.057	0.358	0.434	0.151	0
A. stylosum	0.057	0.396	0.396	0.151	0
A. tanguticum	0.057	0.396	0.485	0.132	0
A. vilmoriniaum	0.057	0.340	0.453	0.151	0
A. weixiense	0.057	0.358	0.434	0.151	0
A. habaense	0.039	0.434	0.377	0.151	0
A. macrorhynchum	0.038	0.434	0.396	0.132	0
A. paniculigerum var. wulingense	0.057	0.485	0.377	0.151	0
A. transsectum	0.038	0.396	0.485	0.151	0
A. tschangbaischanense	0.057	0.396	0.485	0.132	0
A. umbrosum	0.038	0.358	0.453	0.151	0
A. volubile	0.038	0.434	0.396	0.132	0

PR2-bias plot analysis

Back to article page

ISSN: 1471-2164

Contact us

Submission enquiries: bmcgenomics@biomedcentral.com
General enquiries: ORSupport@springernature.com