Table 9 Primer sequences for qPCR analysis of Cse4, PolII and Ste12 ChIPs
From: Efficient yeast ChIP-Seq using multiplex short-read DNA sequencing
qPCR experiment | Pair name | Primer name | Sequence |
|---|---|---|---|
Cse4 | Cse4P1 | Cse4P1for | GATCAGCGCCAAACAATATGGAAAATCC |
Cse4 | Cse4P1 | Cse4P1rev | AACTTCCACCAGTAAACGTTTCATATATCC |
Cse4 | Cse4P2 | Cse4P2for | CGTATTACAATGGCCGAAGGC |
Cse4 | Cse4P2 | Cse4P2rev | GCGACAACAAGAGGGAAATGA |
Cse4 | Cse4P3 | Cse4P3for | CGTCCAAACATGAAAGTGCTCC |
Cse4 | Cse4P3 | Cse4P3rev | CAGCGATTGACTTTCTCCCATT |
Cse4 | Cse4P4 | Cse4P4for | GAAGCGTTATGGAACCTGTCGAA |
Cse4 | Cse4P4 | Cse4P4rev | GTCGGTCGTCCAATATCATCGTAAA |
PolII | Pol2P1 | Pol2P1for | ACCGGTACAAGGACAAGACG |
PolII | Pol2P1 | Pol2P1rev | GTTCGTTCTCACGCACTTCA |
PolII | Pol2P2 | Pol2P2for | AAGACGCTCGAAACCAAGTG |
PolII | Pol2P2 | Pol2P2rev | GCTCACGTTTTGCAATGATG |
PolII | Pol2P3 | Pol2P3for | GACCGTTGCAAGGATTGATAA |
PolII | Pol2P3 | Pol2P3rev | TCAACCGAAGGAAGGAGAAA |
PolII | Pol2P4 | Pol2P4for | ATTGCCTGGTTCTTGTCCTG |
PolII | Pol2P4 | Pol2P4rev | CGTTGGCATATCACACCTTG |
Ste12 | Ste12P1 | Pseudo35 | CCCGTAGTCCGGTTTAATCA |
Ste12 | Ste12P1 | Pseudo36 | AACTGTGCATGAGCCAAGAG |
Ste12 | Ste12P2 | Pseudo37 | AAAAGGAGATAGGGCCCAGA |
Ste12 | Ste12P2 | Pseudo38 | CCAGAACAGCCAGCTAGACC |
Ste12 | Ste12P3 | Pseudo39 | TCGGGCTTCTAAGGCAAATA |
Ste12 | Ste12P3 | Pseudo40 | TCCTTTAAATGATGTTGCGATG |
Ste12 | Ste12P4 | Pseudo41 | TGTAGCCCAACGGATTCTTC |
Ste12 | Ste12P4 | Pseudo42 | AGAAGCTTTGCCAGGTGAAA |