Chromo-some | Structure ΔK (extreme value) | Associated marker (AS)/outlier PS and BS | Association mapping | Markers at the same position on the available maps as the associated, redundant and markers under selection | Rye map [15] (cM) | Triticale map[19] (cM) | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  |  | TASSEL | SML |  |  |  | |||||||
 |  |  | Marker name | Redundant markers | GML ( p -value) | r 2 | MLM ( p -value) | r 2 | Bonferroni test | Marker name | p- value (whiteout assuming data structure) |  |  |  |
3R | K2 (3 100) | AS | wPt-3564 | - | 3.63E-09 | 0.220 | 7.92E-04 | 0.117 | 1.31E-03 | wPt-3564 | 0.0000 | - | 177.6 | - |
 |  |  | - | - | - | - | - | - |  | rPt-401520 | 0.0145 | rPt-507396, rPt-507318 | 308.4 | - |
 |  | PS | rPt-400318 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-508819 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-390252 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-400789 | 349.3 | - |
 |  |  | rPt-508975 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-400864, rPt-402392, rPt-400152, wPt-6762, wPt-7540 | - | 50.6 |
 |  |  | rPt-2965 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-346892, rPt-347072, rPt-346946, rPt-347454, rPt-346755 | 109.4 | - |
 |  |  | rPt-402334 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
4R | K2 (8 300) | AS | rPt-505674 | - | 1.99E-07 | 0.146 | 8.01E-07 | 0.153 | 3.40E-04 | rPt-505674 | 0.0194 | rPt-507649, rPt-401692 | 160.1 | - |
 |  |  | rPt-507784 | - | 8.02E-07 | 0.152 | 4.23E-05 | 0.126 |  | - | - | rPt-507581 | 348.4 | - |
 |  |  | rPt-401376 | - | 1.74E-06 | 0.144 | 1.53E-04 | 0.107 |  | rPt-401376 | 0.0125 | rPt-390125, rPt-346609, | 163.8 | - |
 |  |  |  | rPt-399885 | - | - | - | - |  | - | - | rPt-509441, rPt-513924, rPt-508199, rPt-1422, rPt-400270, rPt-6513, rPt-399885, tPt-5795 | 160.7 | 67.3 |
 |  |  |  | rPt-390125 | - | - | - | - |  | - | - | - | 163.8 | - |
 |  |  |  | rPt-400270 | - | - | - | - |  | - | - | - | 161.3 | 67.3 |
 |  |  |  | rPt-389881 | - | - | - | - |  | - | - | - | 163.2 | - |
 |  |  | rPt-402237 | - | 4.07E-06 | 0.135 | 5.22E-06 | 0.152 |  | - | - | rPt-401410 | 124.3 | - |
 |  |  | rPt-508577 | - | 2.30E-05 | 0.099 | 1.36E-04 | 0.088 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-411417 | - | 3.71E-05 | 0.094 | 1.65E-04 | 0.086 |  | - | - | - | 7.1 |  |
 |  |  | rPt-402563 | - | 3.79E-04 | 0.088 | 3.49E-03 | 0.068 |  | rPt-402563 | 0.0087 | - | - | - |
 |  |  | - | - | - | - | - | - | - | rPt-509188 | 0.0135 | rPt-402590, rPt-389763 | 94.0 | - |
 |  |  | - | - | - | - | - | - | - | rPt-410768 | 0.0184 | rPt-507981 | 238.1 | - |
 |  | PS | rPt-505775 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-505352 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-402302, rPt-506593, rPt-398512 rPt-389700, rPt-9611, rPt-509695, rPt-7906, rPt-400317, rPt-401825, tPt-514203, rPt-507403, tPt-512937, rPt-505288, wPt-9994 | 154.3 | 58.4 |
 |  |  | rPt-400317 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-389700, rPt-9611, rPt-509695, rPt-7906, rPt-505775, rPt-401825, tPt-514203, rPt-507403, tPt-512937, rPt-505288, wPt-9994 | 153.7 | 58.4 |
 |  | BS | rPt-507894 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-506357, rPt-399506, rPt-509554, rPt-509722, tPt-512921, wPt-2714 | 139.1 | 55.1 |
 |  |  | rPt-506357 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-507894 | 139.1 | - |
 |  |  | rPt-506527 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-411417 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 7.1 | - |
 |  |  | rPt-389465 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-508454 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-389455 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-506540 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-507403 | - | - | - | - | - | - | - | - | tPt-512937 | - | 59.5 |
 |  |  | rPt-508638 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-508722 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-507894, rPt-399506, rPt-509554, tPt-512921, wPt-2714 | - | 55.1 |
 |  |  | rPt-506534 | - | - | - | - | - | - | - | - | wPt-8954 | - | 52.9 |
 |  |  | rPt-402302 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-506593, rPt-505352, rPt-398512 | 154.0 | - |
6R | K2 (88) | AS | rPt-399834 | - | 3.75E-09 | 0.178 | 1.67E-07 | 0.169 | Â | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-507199 | - | - | - | - |  | - | - | rPt-8205 | - | 43.4 |
 |  |  |  | rPt-507896 | - | - | - | - |  | - | - | rPt-3995874, rPt-399777, rPt-399399, rPt-506885, tPt-513728, rPt-507896, rPt-399587, rPt-411022, rPt-401093, rPt-390525 | - | 45.6 |
 |  |  | rPt-402561 | - | 3.32E-08 | 0.158 | 8.42E-07 | 0.150 | 4.27E-04 | - | - | wPt-6978, wPt-2013, wPt-1320, rPt-506799, rPt-505233, rPt-400005, rPt-400819 | - | 44.5 |
 |  |  | rPt-390636 | - | 1.29E-06 | 0.126 | 8.13E-06 | 0.124 |  | - | - | - | 549.5 | - |
 |  |  | rPt-401083 | - | 8.22E-06 | 0.110 | 2.96E-05 | 0.110 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-402018 | - | 1.14E-05 | 0.107 | 8.97E-05 | 0.097 |  | - | - | - | 486.1 | - |
 |  |  | rPt-402447 | - | 1.14E-05 | 0.107 | 8.97E-05 | 0.097 |  | - | - | - | 486.1 | - |
 |  |  | rPt-507674 | - | 1.14E-05 | 0.107 | 8.97E-05 | 0.097 |  | - | - | - | 430.4 | - |
 |  |  | rPt-402015 | - | 1.14E-05 | 0.107 | 8.97E-05 | 0.097 |  | - | - | - | 486.1 | - |
 |  |  | rPt-508379 | - | 1.53E-05 | 0.105 | 5.14E-05 | 0.103 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-399406 | - | 3.28E-05 | 0.098 | 1.73E-04 | 0.090 |  | - | - | - | 486.1 | - |
 |  |  | rPt-505870 | - | 8.60E-05 | 0.089 | 2.26E-04 | 0.087 |  | - | - | rPt-509502 | 540.6 | 85.7 |
 |  |  | - | - | - | - | - | - | - | rPt-390698 | 0.016 | rPt-389306, rPt-402575, wPt-1676, rPt-508661, tPt-6200, rPt-507438, rPt-401326, rPt-398845, wPt-8548 rPt-505525, wPt-2077, rPt-389414, rPt-508426, rPt-509027, rPt-401648, Pt-410992, rPt-400907, rPt-389714, tPt-512866, Xrems1247 | 93.0 | 4.4 |
 |  |  | - | - | - | - | - | - | - | rPt-509167 | 0.006 | - | 556.9 | - |
 |  |  | - | - | - | - | - | - | - | rPt-506198 | 0.007 | - | - | - |
 |  |  | - | - | - | - | - | - | - | rPt-505347 | 0.011 | - | - | - |
 |  | PS | rPt-401893 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-389665, rPt-508711 | 148.6 | - |
 |  | BS | rPt-401470 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-389991 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-411086 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-505673 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-506099 | - | - | - | - | - | - | - | - | rPt-509333, rPt-509333, rPt-506902, rPt-399825, rPt-411161, rPt-399879, wPt-6868, wPt-0935 | 381.9 | 51.2 |
 |  |  | rPt-509333 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-402561 | - | - | - | - | - | - | - | - | wPt-6978, wPt-2013, wPt-1320, rPt-506799, rPt-505233, rPt-400005, rPt-400819 | - | 44.5 |
 |  |  | rPt-399991 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-399245 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-509728 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-390337 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-400060 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-508690 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-401554 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
7R | K2 (15 300) | AS | rPt-401366 | - | 1.83E-08 | 0.177 | 1.09E-05 | 0.130 | Â | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-506317 | - | - | - |  |  | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-508078 | - | - | - |  |  | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-509357 | - | - | - |  |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-509359 | - | 1.83E-08 | 0.177 | 1.09E-05 | 0.130 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-505798 | - | 1.83E-08 | 0.177 | 1.09E-05 | 0.130 |  | rPt-505798 | 0.0096 | - | - | - |
 |  |  | rPt-508078 | - | 1.83E-08 | 0.177 | 1.09E-05 | 0.130 |  | rPt-508078 | 0.0009 | - | - | - |
 |  |  | rPt-509056 | - | 6.03E-08 | 0.186 | 4.23 E-06 | 0.169 |  | - | - | - | 232.8 | - |
 |  |  | rPt-505154 | - | 6.03E-08 | 0.186 | 4.23 E-06 | 0.169 | 2.00E-03 | - | - | - | 232.8 | - |
 |  |  | rPt-8750 | - | 3.61E-06 | 0.144 | 3.25 E-05 | 0.139 |  | rPt-8750 | 0.0038 | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-399570 | - | - | - | - |  | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-401526 | - | - | - | - |  | - | - | rPt-398753, rPt-400372, wPt-2793, rPt-400061, wPt-345783, rPt-506142, wPt-4738, rPt-506028, wPt-11703, rPt-508380 | - | 35.7 |
 |  |  |  | rPt-400816 | - | - | - | - |  | - | - |  | - |  |
 |  |  |  | rPt-399664 | - | - | - | - |  | - | - |  | - |  |
 |  |  |  | rPt-399292 | - | - | - | - |  | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-390741 | - | - | - | - |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | SCM92_177 | - | 8.57E-06 | 0.135 | 9.05 E-04 | 0.092 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-390593 | - | 1.85E-05 | 0.126 | 1.28 E-03 | 0.087 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  |  | rPt-401828 | - | - | - | - |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | tPt-8771 | - | 4.67E-05 | 0.116 | 3.70 E-04 | 0.104 |  | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-399325 | - | 8.95E-05 | 0.090 | 1.39 E-03 | 0.066 |  | rPt-399325 | 0.005 | - | - | 92.7 |
 |  | PS | rPt-400793 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | SCM16_259 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  | BS | rPt-401363 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-509288 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-401221 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | SCM92_295 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-389372 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-506250 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-399665 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-508868 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-402262 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 |  |  | rPt-390750 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |